Hola,
Normalmente esto sucede cuando K-Meleon no pudo cerrarse bien o el sistema sufrió un cierre inesperado. En estos caso el perfil de usuario de K-Meleon puede quedar corrupto y K-Meleon cuando vuelve a ser ejecutado lo detecta y crea un perfil de usuario nuevo.
Seguramente puedas encontrar el perfil de usuario anterior y copiar los marcadores (bookmarks.html o del archivo de backup: bookmarks_backup.html).
Los perfiles de usuario de K-Meleon lo puedes encontrar en las siguientes rutas:
C:\K-Meleon\Profiles\!!!!!!!!.default (donde ! significa un caracter aleatorio)
C:\Documents and Settings[usuario_Windows]\Datos de programa\K-Meleon\!!!!!!!!.default
Saludos.
K-Meleon in Spanish